据日本《朝日新闻》６月６日头版报道，日本外务大臣冈田克也等１１名前内阁成员，留任菅直人新内阁并担任原职，而华裔女议员莲舫则出任新内阁消费者与少子化担当大臣，原行政刷新担当大臣枝野幸男，则取代受政治献金丑闻牵连的小泽一郎，成为民主党干事长。

　　６月５日，新首相菅直人做出如下人事安排：委任原行政刷新担当大臣枝野幸男为民主党干事长，其目前的主要任务是负责指挥即将到来的参院大选；原首相辅佐官荒井聪将出任国家战略担当大臣；野田佳彦升任为财务大臣，以继续推行菅直人任财务大臣时的财政政策；华裔议员莲舫将出任消费者与少子化担当大臣；原国家战略担当大臣仙谷由人将出任官房长官职务。

　　此外，前内阁的外务大臣冈田克也、总务大臣原口一博、法务大臣千叶景子、文部科学省大臣川端达夫、厚生劳动大臣长妻昭、经济产业大臣直嶋正行、国土交通大臣前原诚司、环境大臣小泽锐仁、防卫大臣北泽俊美、国家公安委员长中井恰、金融兼邮政问题担当大臣（国民新党代表）龟井静香等１１位大臣，均留任新内阁并任原职。选择离开的，只有前官方长官平野博文及前农林水产担当大臣赤松广隆（因口蹄疫问题应对不力引咎辞职）。

　　《朝日新闻》同时报道说，该报通过电话访问方式进行民调显示，民主党的支持率正呈Ｖ型止跌回升趋势。目前对新政权充满期待的受访者达到５９％，基本接近原来对鸠山新政权的期待率（６３％）。对于即将到来的参院选举，有３３％的被调查者表示，愿意将票投给民主党，比５月末的调查结果上升１３％。此外，有４２％的受访者认为，菅直人将给民主党带来变化，不过也有４９％的人悲观地认为，即便菅直人出任新代表，也不会给民主党带来什么变化。

　　《朝日新闻》评论说，由于前首相鸠山由纪夫及民主党干事长小泽一郎辞职，让在野党失去了攻击目标，为民主党赢得未来的参院大选提供了有利条件。

　　共同社则评论认为，对于菅直人新政权而言，将直面鸠山执政时一度冷却的日美关系等复杂问题。对日本而言，还必须加强与美国的同盟国关系，选定冲绳县名护市边野古为美军普天间机场迁入地的《日美联合声明》能否切实得到推进，或将成为新政权的试金石。就在菅直人当选新首相的当天，鹿儿岛县德之岛的三位町长就表示：“将继续向新首相表明反对迁入计划。”这些老问题将继续困扰新政权。

　　另据日本媒体６月６日报道，因鸠山首相辞职前曾表示，会于６月１２日前往上海出席世博会“日本馆日”活动，日本新首相菅直人可能承袭这个外交日程，于１２日访问中国。

　　日本新首相菅直人１９４６年出生于日本西部的山口县，家世一般，日本媒体称他为“市民政治家”或“蓝领政治家”，以区别于前首相鸠山由纪夫、麻生太郎、福田康夫、安倍晋三等含着“金勺子”出生的世家子弟。在就读于东京工业大学应用物理系期间，菅直人曾发明了自动麻将桌的计数器，并因此获得了专利。１９９６年９月，菅直人与鸠山由纪夫合作组成民主党并出任该党代表，同年９月就任该党政策调查会长。２００４年５月，菅直人因被揭发未缴纳年金而被迫辞去党首职务。菅直人因此把头发剃光并以苦行僧人装扮游走８８个乡镇的寺庙。不过后来年金事务所发现，是该所忘记记录了菅直人缴纳的年金。

　　出任新内阁消费者与少子化担当大臣的华裔女议员莲舫，曾在北京大学留学，并担任朝日电视台主播，在日本拥有较高知名度。她的父亲是台湾省台南白河人。莲舫在鸠山内阁时期曾负责政府各部门事业费用预算甄别工作，并在议会中与政府各部门的主要责任人针锋相对。莲舫“话锋犀利”被日本政界所公认。此次，菅直人决定起用莲舫，表现出其希望继续削减政府事业费的决心。